北京市眼科研究所位于北京市崇文门内大街后沟胡同17号，是隶属于首都医科大学附属北京同仁医院的一家集科研、教学、临床于一体，在国内外眼科界具有一定影响的科研机构，也是国内成立最早的眼科研究机构，以及世界卫生组织在我国的防盲合作中心，主要面向社会，以提高科研质量，重视科研的临床应用研究、营造良好的学习与科研环境为目标，致力于改善视觉损害患者的生活质量，为广大人民群众服务。
北京市眼科研究所设有基础部、应用基础部和行政部三大部，共分眼微生物、眼生化、眼药理、眼病理、眼生理、防盲办公室、情报室、研发室、行